乾隆五十一年臺灣林爽文起義與康熙六十年朱一貴起義一樣，「皆因官員貪婪，激變民亂」。所以，乾隆皇帝對台政策之調整亦從整飭涉台官員開始。凡與臺灣地方有關之臺灣鎮道、福建水陸提督、福建督撫、巡台禦史等均在整飭之列。比如，乾隆五十二年十二月，福康安大軍打通南北兩路、林爽文起義即將蕩平之際，朝廷便開始對此次民變進行檢討。十二月十七日的上諭稱：「向來三年一次派出巡台禦史滿漢各一員，前往巡視；該禦史職分較小，且由京派往，不能備悉該處情形，易為地方官欺蒙，不過虛應故事，屬有名無實。嗣後著照四川巡查促浸贊拉之例，令該督、撫及水師、陸路兩提督每年輪值一人前往臺灣，嚴行稽查。」
無論是循例巡台，還是因事巡台，每遇輪值巡台之期，一般是由福建督撫奏明朝廷，說明巡台緣由、巡台大員、巡台日期。而巡台大員從離開福建衙署到巡台結束回署，必將其所見所聞一一奏報，因此留下大量珍貴文獻。本書依據海峽兩岸宮藏檔案，整理福建大員輪值巡台和閩撫駐台（光緒元年至十一年）奏摺，並按照參與輪值巡台或駐台的福建大員之官職分為福州將軍巡台奏摺、福建督撫巡台奏摺、福建水陸提督巡台奏摺，及其他巡台奏摺，共四卷、四百七十一份。
